Історія Івано-Франківськa філії розпочалася у 1964 році зі створення зональної агрохімічної лабораторії як самостійної виробничо-наукової установи при Науковому інституті землеробства і тваринництва західних регіонів України.
За 60 років діяльності структура пройшла ряд реорганізацій. З березня 2013 року перейменована на Івано-Франківську філію державної установи «Інститут охорони ґрунтів України».